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益生菌是一類對宿主有益的活性微生物，是定植于人體腸道、生殖系統內，能產生確切健康從而改善宿主微生態平衡、發揮有益作用的活性有益微生物的總稱。人體、動物體內有益的或主要有：酪酸梭菌、乳桿菌、雙歧桿菌、放線菌、酵母菌等。 目前世界上研究的功能強大的產品主要是以上各類微生物組成的復合活性益生菌，其廣泛應用于生物工程、工農業、食品安全以及生命健康領域。在國外已開發出數以百計的益生菌產品，其中包括：含益生菌的酸牛奶、酸乳酪、酸豆奶以及含多種益生菌。

什么是益生菌？
無處不在，它們同樣存在于人類體表和體腔內形成大量微生物群，人體正常菌群種類約500-1000余種，數量達100萬億個，比人體細胞數量還要多10倍，大約有1.5-2千克。
研究發現，多種代謝性疾病、性疾病甚至都和腸道菌群存在密切關系。如華大基因的研究人員2012年發現，Ⅱ型糖尿病患者出現了中度的腸道微生物菌群失調，產丁酸在Ⅱ型糖尿病患者中有所減少，而丁酸主要可調節人體腸道微生態平衡，對腸道健康起著關鍵性的作用。
人類體內和體表的好對人體來說，起著幫助身體消化食物、合成某些維生素、形成保護層對抗致病等作用。2001年糧農組織(FAO)和世界衛生組織(WHO)對益生菌做了如下定義:通過攝取適當的量,對食用者的身體健康能發揮有效作用的活菌，英文叫做“Probiotics”。
國內常用于食品的益生菌菌種有乳雙岐桿菌、保加利亞乳桿菌、嗜酸乳桿菌、植物乳桿菌、羅伊氏乳桿菌、鼠李糖乳桿菌、嗜熱鏈球菌等幾十種，具體可參考國家衛計委新公布的可用于食品的菌種名單。而可用于嬰幼兒食品的菌種，根據公告2011年第25號，批準了四個菌種，包括六個的菌株。

在國外已開發出數以百計的益生菌保健產品，其中包括：含益生菌的酸牛奶、酸乳酪、酸豆奶以及含多種益生菌的口服液、片劑、膠囊、粉末劑、噴劑等等。針對人研究的不多，國內對益生菌的認知度還不是很強，這使得益生菌的產品線應用還不是很廣泛，因為存活率就是一大技術難題。

許多益生菌株在胃腸道內可產生消化酶，這些酶可幫助人體更好地消化所攝入的食品及吸收食品中的營養成分。益生菌還可競爭性抑制有害微生物吸收營養物質及進入血液循環系統。嗜酸乳桿菌是這方面的代表菌株，可分泌消化乳糖的乳糖酶，從而緩解乳糖不耐癥。

益生菌，這一概念早來源于希臘語，意思是“對生命有益”（for life）。早在遠古時代，人類的日常飲食中就已經含有乳酸發酵類的食品了。

益生菌是一個適合在低溫環境下生存的菌種，2001年3月中國衛生部發布了衛法監發〔2001〕84號,益生菌類保健食品評審規定第十條明確指出：不提倡以液態形式生產益生菌類保健食品活菌產品，因益生菌已經過科學實驗認證液態存活非常難,且益生菌怕水,所以消費者在購買益生菌的時候一定要選擇冷藏運輸,或者在超市冰柜冷藏柜中的益生菌粉狀，而其他一些液態飲料以及網絡銷售的無冷藏運送的產品益生菌存活非常低。